More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0102 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0102  prephenate dehydratase  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00124161 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1150  prephenate dehydratase  84.11 
 
 		 262 aa  450  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  5.713990000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0111  prephenate dehydratase  71.84 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0075  prephenate dehydratase  80 
 
 		 256 aa  379  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1344  prephenate dehydratase  39.77 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00546252  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  39.84 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  32.48 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.95 
 
 		 358 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.58 
 
 		 358 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.58 
 
 		 358 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  34.39 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  30.92 
 
 		 359 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.44 
 
 		 387 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  32.26 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  34.89 
 
 		 418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.76 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  37.76 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.22 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.2 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  33.97 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  32.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  32.17 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  34.72 
 
 		 552 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.07 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  31.7 
 
 		 271 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 552 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 362 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  31.61 
 
 		 364 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  34.72 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  31.29 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  31.88 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  31.41 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  31.29 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  30.77 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  31.29 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  32.47 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  35.35 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  32.48 
 
 		 371 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  32.48 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.36 
 
 		 358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  31.61 
 
 		 364 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  30.87 
 
 		 402 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  32.48 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  33.22 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  34.2 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  30.45 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  33.57 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  32.17 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  31.23 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  32.9 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.38 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.34 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  31.83 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  30.74 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.7 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  31.01 
 
 		 382 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.92 
 
 		 367 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  32.98 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  32.59 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  31.85 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  31.49 
 
 		 359 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.45 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  32.17 
 
 		 293 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  32.76 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  32.41 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  32.71 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  30.55 
 
 		 359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  31.08 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  33.13 
 
 		 706 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  30.32 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  32.61 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1299  prephenate dehydratase  33.99 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  31 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  30.66 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  31.31 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  29.87 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  32.59 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  34.29 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  30.29 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  32.48 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  32.48 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  30.87 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  32.62 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>