More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1644 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  100 
 
 
355 aa  721    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.42 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  40.11 
 
 
355 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.62 
 
 
355 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  39.49 
 
 
372 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.2 
 
 
360 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40 
 
 
365 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.89 
 
 
359 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  39.32 
 
 
355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.03 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  37.68 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.95 
 
 
361 aa  212  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.44 
 
 
371 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  37.18 
 
 
373 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.44 
 
 
373 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  36.57 
 
 
358 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  35.46 
 
 
359 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  36.31 
 
 
374 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  37.96 
 
 
399 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  35.98 
 
 
379 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.9 
 
 
371 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  35.46 
 
 
359 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.77 
 
 
367 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  35.75 
 
 
374 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  35.77 
 
 
366 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.54 
 
 
358 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  35.03 
 
 
371 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  36.57 
 
 
377 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.03 
 
 
371 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  34.93 
 
 
365 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.72 
 
 
358 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.11 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.7 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  33.43 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.03 
 
 
360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  32.96 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.06 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  34.07 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.81 
 
 
365 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  34.88 
 
 
419 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  34.56 
 
 
385 aa  199  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  39.33 
 
 
363 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  34.39 
 
 
371 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.96 
 
 
387 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  35.11 
 
 
366 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  34.94 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  36.47 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.04 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.04 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.04 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  35.11 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.04 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.75 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.04 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.04 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  34.39 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.04 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.7 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.47 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.43 
 
 
367 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.43 
 
 
364 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.11 
 
 
382 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  41.67 
 
 
362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  35.9 
 
 
360 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  32.11 
 
 
359 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.75 
 
 
368 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  37.08 
 
 
359 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  32.51 
 
 
365 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.77 
 
 
358 aa  193  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  32.2 
 
 
359 aa  193  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.96 
 
 
364 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  34.57 
 
 
418 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  32.96 
 
 
364 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.67 
 
 
358 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.67 
 
 
358 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  32.24 
 
 
365 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  38.44 
 
 
706 aa  192  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  35.14 
 
 
359 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.44 
 
 
362 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  37.6 
 
 
362 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  35.08 
 
 
374 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.11 
 
 
368 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.52 
 
 
413 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  33.88 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  36.9 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  34.93 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  31.92 
 
 
356 aa  190  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.27 
 
 
360 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.53 
 
 
371 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  33.71 
 
 
372 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  33.89 
 
 
358 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.73 
 
 
358 aa  185  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.73 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.44 
 
 
357 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.44 
 
 
357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  32.68 
 
 
357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  33.89 
 
 
357 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.72 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  36.18 
 
 
360 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>