More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1150 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1150  prephenate dehydratase  100 
 
 		 262 aa  540  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  5.713990000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0102  prephenate dehydratase  84.11 
 
 		 310 aa  450  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00124161 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0111  prephenate dehydratase  70.87 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0075  prephenate dehydratase  73.26 
 
 		 256 aa  359  2e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1344  prephenate dehydratase  38.64 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00546252  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  38.37 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.08 
 
 		 358 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.02 
 
 		 356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  34.98 
 
 		 361 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.34 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  33.59 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.84 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.13 
 
 		 413 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  31.46 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 288 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  31.16 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  30.51 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  32.86 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  31.6 
 
 		 366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0012  prephenate dehydratase  37.43 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000330103  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.71 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.81 
 
 		 387 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 382 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  31.72 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  32.32 
 
 		 371 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  30.71 
 
 		 402 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  32.83 
 
 		 371 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  29.81 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  31.62 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  31.43 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.45 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  31.03 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.58 
 
 		 371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 418 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.45 
 
 		 373 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  32.7 
 
 		 359 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  32.08 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  32.17 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  32.08 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.21 
 
 		 364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 552 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  31.34 
 
 		 374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  32.32 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  31.68 
 
 		 552 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 293 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  32.93 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  32.93 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.09 
 
 		 367 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.09 
 
 		 364 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  32.09 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  31.2 
 
 		 365 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  32.53 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  31.16 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  32.93 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  32.93 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  30.83 
 
 		 365 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.7 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  32.32 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  31.82 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  31.34 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  34.09 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  31.69 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  33.47 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.12 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.01 
 
 		 372 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  30.48 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.6 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  32.96 
 
 		 391 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  30.08 
 
 		 365 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  31.2 
 
 		 364 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  31.94 
 
 		 358 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.2 
 
 		 368 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  29.55 
 
 		 385 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  32.86 
 
 		 706 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  32 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.08 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  30.08 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  33.19 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  32.2 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  29.96 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  31.32 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  31.18 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  31.2 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  31.52 
 
 		 360 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  32.47 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  31.48 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  34.47 
 
 		 362 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.94 
 
 		 368 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>