More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0111 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0111  prephenate dehydratase  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0102  prephenate dehydratase  71.84 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00124161 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1150  prephenate dehydratase  70.87 
 
 		 262 aa  378  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  5.713990000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0075  prephenate dehydratase  75.29 
 
 		 256 aa  357  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1344  prephenate dehydratase  36.78 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00546252  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  35.85 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.6 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 356 aa  123  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.95 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.58 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.58 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  31.97 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  34.59 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  34.59 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  29.72 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.22 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  32.88 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  32.61 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.94 
 
 		 362 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.1 
 
 		 387 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.96 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 356 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.46 
 
 		 367 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.46 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  32.46 
 
 		 364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.09 
 
 		 355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.84 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  32.2 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.83 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 364 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  32.46 
 
 		 363 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  29.83 
 
 		 359 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 372 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  29.83 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  32.71 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  31.56 
 
 		 552 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.6 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  32.6 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  32.84 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  30.47 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  30.71 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  31.37 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  30.77 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  31.85 
 
 		 374 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  30.04 
 
 		 358 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  29.35 
 
 		 402 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 364 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 552 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  31.06 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  32.09 
 
 		 365 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.51 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  32.73 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.63 
 
 		 413 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  33.21 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  30.48 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 360 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  32.59 
 
 		 360 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  31.16 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.33 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  29.56 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.1 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  29.9 
 
 		 392 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  32.47 
 
 		 371 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  36.23 
 
 		 706 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  29.84 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  32.95 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1561  prephenate dehydratase  32 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  33.71 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  28.57 
 
 		 384 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  31.64 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  29.75 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  28.16 
 
 		 664 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  28.16 
 
 		 659 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  28.52 
 
 		 664 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  32.34 
 
 		 355 aa  99.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  33.82 
 
 		 362 aa  99.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.85 
 
 		 360 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  28.16 
 
 		 664 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  33.08 
 
 		 360 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  34.33 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  30 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  28.16 
 
 		 664 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0012  prephenate dehydratase  32.37 
 
 		 206 aa  98.6  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000330103  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  30.72 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  32.1 
 
 		 365 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  30.74 
 
 		 377 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.47 
 
 		 671 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>