More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1344 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1344  prephenate dehydratase  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00546252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1150  prephenate dehydratase  38.64 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  5.713990000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0102  prephenate dehydratase  39.77 
 
 		 310 aa  191  8e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00124161 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0111  prephenate dehydratase  36.78 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  37.88 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0075  prephenate dehydratase  39.62 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  34.69 
 
 		 418 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.79 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.48 
 
 		 355 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  35.11 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.57 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.34 
 
 		 358 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.59 
 
 		 365 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  36.76 
 
 		 552 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.96 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.96 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 552 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.33 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  32.29 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  34.21 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.08 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.08 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.08 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  32.61 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  33.08 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  34.32 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  33.83 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  31.85 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.08 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  32.45 
 
 		 361 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.74 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0012  prephenate dehydratase  38.54 
 
 		 206 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000330103  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  32.71 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  30.74 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  34.81 
 
 		 274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  34.07 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.32 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  36.46 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  30.39 
 
 		 371 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  32.45 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  32.33 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  31.84 
 
 		 402 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.39 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  32.09 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  31.73 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  34.72 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  32.97 
 
 		 382 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  31.58 
 
 		 365 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  31.84 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.86 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  34.32 
 
 		 358 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 382 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.47 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  33.92 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  33.57 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  31.73 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.18 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  31.82 
 
 		 293 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  32.96 
 
 		 355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  31.72 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  30.77 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  30.88 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  34.07 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  32.47 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  31.02 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  28.78 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  31.99 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  32 
 
 		 360 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  32.84 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  30.48 
 
 		 366 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.42 
 
 		 385 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  26.04 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  30.46 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.6 
 
 		 632 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  36.18 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  29.05 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  29.09 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  30.63 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  29.96 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  29.59 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  31.29 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  33.82 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  29.21 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  32.62 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  30.36 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>