More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0141 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 306 aa  607  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  76.8 
 
 		 324 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  61.74 
 
 		 315 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  60.19 
 
 		 315 aa  358  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  59.48 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  54.22 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  52.63 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  52.48 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  52.77 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  52.9 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  50.96 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  50.49 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  50.16 
 
 		 335 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  52.96 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  50.98 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  48.84 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  50.64 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  50.49 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  46.95 
 
 		 314 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  45.62 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  44.79 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  47.71 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  44.48 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  45.31 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  45.31 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  45.31 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  45.26 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  41.4 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  45.26 
 
 		 277 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  45.26 
 
 		 277 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  48.24 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  41.09 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  42.37 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  39.07 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  40.86 
 
 		 386 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  43.53 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.97 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.34 
 
 		 371 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  43.59 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.78 
 
 		 359 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.42 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.15 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  39.05 
 
 		 358 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.45 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.24 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.12 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.73 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.15 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.6 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  36.79 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 358 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.8 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  38.35 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.09 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36.86 
 
 		 367 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  36.86 
 
 		 364 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.86 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.96 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  40.79 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.29 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.46 
 
 		 371 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.73 
 
 		 364 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.59 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  38.13 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.71 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 362 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37.99 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.77 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.43 
 
 		 413 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.96 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  34.3 
 
 		 293 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.4 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  35.61 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.77 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.83 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.56 
 
 		 358 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 283 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  36.56 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  35.25 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  38.38 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.67 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  35.97 
 
 		 283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  35.97 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  37.35 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  35.97 
 
 		 283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>