More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1274 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  100 
 
 
283 aa  583  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  60.78 
 
 
286 aa  338  5e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  44.12 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40.43 
 
 
280 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  40.22 
 
 
279 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.16 
 
 
373 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  36.08 
 
 
311 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.83 
 
 
277 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
277 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
277 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.14 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  38.41 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.99 
 
 
372 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  39.19 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  39.01 
 
 
367 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  39.01 
 
 
364 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  38.65 
 
 
364 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  39.01 
 
 
364 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  39.19 
 
 
364 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  42.03 
 
 
360 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  38.65 
 
 
364 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  38.55 
 
 
277 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
283 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.55 
 
 
387 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.56 
 
 
371 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.3 
 
 
364 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  34.67 
 
 
274 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.1 
 
 
364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  35.21 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.59 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  37.23 
 
 
382 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.73 
 
 
359 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.13 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  36.88 
 
 
365 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 
315 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  36.62 
 
 
402 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  38.55 
 
 
306 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.21 
 
 
361 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.36 
 
 
359 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.03 
 
 
356 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  37.15 
 
 
413 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  38.27 
 
 
315 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.27 
 
 
386 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  37.46 
 
 
373 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  38.85 
 
 
314 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  38.18 
 
 
305 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.77 
 
 
358 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.4 
 
 
355 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 
305 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.86 
 
 
371 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.23 
 
 
371 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  34.51 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.23 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  36.88 
 
 
349 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.49 
 
 
371 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  34.89 
 
 
278 aa  155  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  35.44 
 
 
279 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.05 
 
 
362 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  35.25 
 
 
287 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  33.09 
 
 
311 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  38.46 
 
 
358 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  38.35 
 
 
373 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.26 
 
 
360 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37.09 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  36.73 
 
 
374 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  37.05 
 
 
318 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  37.36 
 
 
360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.46 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  36.96 
 
 
316 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  34.38 
 
 
312 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.31 
 
 
382 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37 
 
 
360 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  37.19 
 
 
374 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.74 
 
 
355 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  37.19 
 
 
374 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  34.63 
 
 
309 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  38.46 
 
 
359 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  35.87 
 
 
385 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.65 
 
 
355 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  34.39 
 
 
293 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.05 
 
 
367 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.09 
 
 
359 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.41 
 
 
368 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  35.21 
 
 
326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.84 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  39.93 
 
 
362 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.04 
 
 
358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  35.25 
 
 
306 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  34.86 
 
 
399 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.53 
 
 
360 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  33.33 
 
 
381 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  34.04 
 
 
318 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>