More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01130 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  100 
 
 
316 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  61.13 
 
 
326 aa  345  8e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  60.26 
 
 
327 aa  342  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  50.66 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  53.25 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  52.22 
 
 
335 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  50.65 
 
 
315 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  50.34 
 
 
349 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  48.7 
 
 
315 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  51.99 
 
 
311 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  53.67 
 
 
314 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  48.28 
 
 
324 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  48.84 
 
 
306 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  47.85 
 
 
318 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  47.85 
 
 
314 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  47.3 
 
 
325 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  48.51 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  50.36 
 
 
317 aa  242  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  47.08 
 
 
318 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  47.25 
 
 
318 aa  222  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  49 
 
 
300 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  45.88 
 
 
321 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  43.41 
 
 
312 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  44.49 
 
 
277 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  46.38 
 
 
301 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  43.75 
 
 
277 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  43.75 
 
 
277 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  45.39 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  45.95 
 
 
314 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  45 
 
 
315 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  45 
 
 
315 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  45 
 
 
315 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  43.31 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.31 
 
 
280 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  40.44 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  43.38 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  38.65 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  40.43 
 
 
386 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
278 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.64 
 
 
371 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  33.93 
 
 
303 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.48 
 
 
360 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.27 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40.07 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  40.07 
 
 
306 aa  162  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.11 
 
 
276 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.18 
 
 
358 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  40 
 
 
372 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.41 
 
 
283 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.73 
 
 
359 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.86 
 
 
367 aa  159  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.43 
 
 
368 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  39.13 
 
 
279 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  42.06 
 
 
328 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  36.13 
 
 
288 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.13 
 
 
288 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.36 
 
 
359 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  39.29 
 
 
360 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  31.77 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  34.41 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.02 
 
 
357 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.87 
 
 
365 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.02 
 
 
357 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.99 
 
 
360 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  35.21 
 
 
355 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.66 
 
 
357 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  39.1 
 
 
413 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37.13 
 
 
274 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  31.99 
 
 
356 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  32.48 
 
 
311 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  36.96 
 
 
283 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.59 
 
 
364 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.59 
 
 
367 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.3 
 
 
364 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.59 
 
 
364 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.14 
 
 
365 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.74 
 
 
364 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.36 
 
 
355 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.69 
 
 
355 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.03 
 
 
358 aa  149  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.59 
 
 
371 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  32.26 
 
 
359 aa  149  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.93 
 
 
274 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.23 
 
 
364 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.81 
 
 
356 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.23 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.63 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  33.57 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.23 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  34.77 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.07 
 
 
382 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  38.63 
 
 
358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  30.91 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.63 
 
 
358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  36.73 
 
 
362 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  37.37 
 
 
282 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.1 
 
 
364 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.74 
 
 
364 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.65 
 
 
371 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>