More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0264 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0264  prephenate dehydratase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0450669  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  72.32 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  74.26 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  69.78 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1702  Prephenate dehydratase  71.69 
 
 		 272 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  39.26 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35.93 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  37.76 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.19 
 
 		 359 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.19 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.26 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.44 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  37.69 
 
 		 360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.07 
 
 		 358 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  39.48 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  39.78 
 
 		 360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  35.45 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  40.25 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 293 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  34.31 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  35.79 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.45 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.96 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  35.36 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  43.62 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  34.04 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 		 386 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  35.23 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  37.97 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.69 
 
 		 413 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  39.41 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.27 
 
 		 364 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.64 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  36.79 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  36.09 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.73 
 
 		 364 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.9 
 
 		 364 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  38.24 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.47 
 
 		 382 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.47 
 
 		 387 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  39.33 
 
 		 358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.33 
 
 		 358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.05 
 
 		 365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.94 
 
 		 371 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  34.33 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  41.77 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.27 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.59 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.27 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  36.25 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  34.7 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  41.42 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.07 
 
 		 364 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  36.69 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  32.7 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  35.93 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.69 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  36.29 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  36.44 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1561  prephenate dehydratase  34.59 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  34.22 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  34.4 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  39.18 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.29 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  36.43 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  35.29 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  36.94 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  36.23 
 
 		 377 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  34.83 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  36.04 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  32.95 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.96 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.45 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.5 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  35.07 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.32 
 
 		 362 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  38.01 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.42 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  34.46 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  34.45 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 327 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  31.54 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  34.69 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  35.96 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 379 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  36.09 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  34.96 
 
 		 366 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  36.56 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>