More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3003 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  100 
 
 		 288 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  48.2 
 
 		 286 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  49.45 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  49.45 
 
 		 285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  48.01 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  49.09 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  47.12 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  47.27 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  49.09 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  49.09 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  46.89 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  47.81 
 
 		 280 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  47.08 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  47.83 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  48.18 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  47.1 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  48.54 
 
 		 286 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  46.72 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  46.72 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  48.72 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  45.14 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  46.55 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  46.62 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  47.29 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  45.82 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  45.82 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  45.85 
 
 		 287 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  47.46 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  46.79 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  47.48 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  48.18 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  46.18 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  46.27 
 
 		 284 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  45.29 
 
 		 287 aa  245  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  47.81 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  46.27 
 
 		 284 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  47.84 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  46.55 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  46.42 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  47.45 
 
 		 277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  44.96 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  44.96 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  43.07 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  44.65 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  44.19 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  43.02 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  41.82 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  39.44 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  35.79 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  32.62 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.31 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.62 
 
 		 391 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.69 
 
 		 358 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  35 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.57 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.31 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  31.87 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 386 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.05 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 393 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  35.4 
 
 		 279 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  34.42 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  31.77 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  35.14 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  35.25 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.18 
 
 		 386 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.151676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.18 
 
 		 386 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.34961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2811  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.18 
 
 		 386 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2861  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.18 
 
 		 386 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0154655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.8 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.62 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 385 aa  143  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  31.87 
 
 		 662 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2994  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.82 
 
 		 386 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  37.37 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  31.5 
 
 		 662 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  31.25 
 
 		 654 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  35.23 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  29.67 
 
 		 657 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>