54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1570 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1570  chorismate mutase  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0840576  hitchhiker  0.0000751534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1764  chorismate mutase  54.95 
 
 
163 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  44.92 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  43.8 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  44.92 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  44.92 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  44.92 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  44.92 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  44.92 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  42.15 
 
 
202 aa  95.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  37.93 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  42.15 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  41.22 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  41.98 
 
 
196 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  39.68 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  40.46 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  40.46 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  38.78 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  40.46 
 
 
197 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  39.69 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  32.39 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  32.39 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  27.57 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  38.1 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  33.61 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2767  chorismate mutase  32.26 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209555  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  34.44 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  34.44 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  35.66 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  38.18 
 
 
191 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  33.61 
 
 
185 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  39.05 
 
 
180 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  34.45 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5080  chorismate mutase  27.4 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  27.52 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5910  chorismate mutase  28.93 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  25.32 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04710  chorismate mutase  28.17 
 
 
155 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3314  chorismate mutase  28.1 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1464  chorismate mutase  32.65 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  30.56 
 
 
185 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  32.38 
 
 
185 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  36.67 
 
 
178 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35 
 
 
393 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  30.12 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.48 
 
 
386 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  30.09 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  28.95 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  28.95 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  28.92 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.18 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  34.48 
 
 
648 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.52 
 
 
386 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  31.82 
 
 
176 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>