60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3544 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  52.81 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  55.48 
 
 		 185 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  44.24 
 
 		 182 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  46.67 
 
 		 177 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  44.1 
 
 		 191 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  43.48 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  41.67 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  41.67 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_003296  RS04710  chorismate mutase  47.02 
 
 		 155 aa  118  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  36.72 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  36.9 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  38.22 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  38.22 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  38.22 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  38.22 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  39.85 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  38.22 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  36.97 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  34.25 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  34.55 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5910  chorismate mutase  40.74 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  35.03 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  34.39 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  37.4 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  36.31 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68480  chorismate mutase  40.41 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.188897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  35.67 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  37.4 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  35.88 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  35.88 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  35.88 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1464  chorismate mutase  33.73 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  32.48 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5928  chorismate mutase  41.1 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1570  chorismate mutase  34.48 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0840576  hitchhiker  0.0000751534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  31.65 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  30.13 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  30.13 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  31.65 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  31.65 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  31.65 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  31.65 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  33.12 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5080  chorismate mutase  33.12 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  31.94 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1764  chorismate mutase  33.7 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  33.09 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  32.12 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  31.94 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2767  chorismate mutase  28.06 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209555  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  32.08 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  32.08 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  32.08 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  32.39 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.33 
 
 		 358 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3314  chorismate mutase  29.52 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 358 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.12 
 
 		 358 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  29.55 
 
 		 379 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>