49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3147 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  42.11 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  38.51 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  36.02 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  37.87 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  34.36 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  42.76 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  42.76 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  42.76 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  38.15 
 
 		 421 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  39.09 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  39.09 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  32.34 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  41.41 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  41.41 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  34.46 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  41.41 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  36.07 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  35.77 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  30.5 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  34.71 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  36.75 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  35.29 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  33.09 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  33.09 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  33.09 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  33.09 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  31.72 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  31.72 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  33.09 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  32.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  32.37 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  31.72 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  31.65 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  34.68 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  33.86 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  36.52 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  31.11 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  32.53 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  32.53 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  30.89 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  33.64 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5928  chorismate mutase  38.81 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  28.03 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  33.64 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  28.03 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68480  chorismate mutase  34.48 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.188897 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5910  chorismate mutase  32.26 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  30.85 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>