55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5099 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  100 
 
 		 178 aa  360  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  55 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  38.64 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  38.6 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  41.18 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  36.05 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  34.84 
 
 		 202 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  35.16 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  35.16 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  34.29 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  34.86 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04710  chorismate mutase  37.58 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  36.02 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5910  chorismate mutase  39.56 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  35.91 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  35.91 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  35.91 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  35.91 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  35.91 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  35.91 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  35.91 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  35.16 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  35.44 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  39.04 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  37.67 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  37.67 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  36.99 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  38.41 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  35.85 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1464  chorismate mutase  41.75 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  31.11 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  37.68 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  37.68 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  31.25 
 
 		 421 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1570  chorismate mutase  36.13 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0840576  hitchhiker  0.0000751534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  31.52 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  31.52 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  34.58 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  34.58 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  34.58 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  34.58 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  34.58 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1764  chorismate mutase  36.04 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  32.52 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5080  chorismate mutase  30.77 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2767  chorismate mutase  30.5 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209555  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3314  chorismate mutase  36.14 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68480  chorismate mutase  33.1 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.188897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  26.34 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  30.77 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  30.53 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  31.17 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  29.9 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  29.9 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  29.9 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>