29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2624 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  47.65 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  47.09 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  45.61 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  35.96 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  34.83 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  42.76 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  36.84 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  32.77 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  32.77 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  36.84 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  32.2 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  31.4 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  40 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  32.38 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  32.08 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  30 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  27.56 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  27.56 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  30.19 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68480  chorismate mutase  31.78 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.188897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  29.25 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  28.3 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  30.51 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  28.3 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  28.3 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  23.87 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>