57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1374 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  98.34 
 
 		 181 aa  369  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  96.69 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  96.69 
 
 		 181 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  52.3 
 
 		 180 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  36.46 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  37.82 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  39.44 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  33.89 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  36.99 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  32.77 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  32.77 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  32.77 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  39.09 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  32.37 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  30.77 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  30.11 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  32.46 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  32.46 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  33.62 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  27.61 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  27.61 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  27.61 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  27.61 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  27.61 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  27.61 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  27.61 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.29 
 
 		 393 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  32.69 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  27.94 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  32.69 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  31.65 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  32.69 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  27.14 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  30.7 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  31.73 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  26.87 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  28.57 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5080  chorismate mutase  32.74 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  29.66 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  28.07 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  31.48 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  30.61 
 
 		 399 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  29.32 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  34.58 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2767  chorismate mutase  33.85 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209555  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  24.81 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  27.27 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04710  chorismate mutase  30.77 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1464  chorismate mutase  34.44 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  30 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  28.06 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  28.06 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1570  chorismate mutase  28.17 
 
 		 234 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0840576  hitchhiker  0.0000751534 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.49 
 
 		 393 aa  41.2  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>