66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3232 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  100 
 
 		 93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1353  chorismate mutase  42.05 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.397236  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  41.38 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  38.1 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  35.23 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.18 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.18 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.18 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.18 
 
 		 373 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  34.88 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 		 375 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  36.25 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3126  chorismate mutase  36.36 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  41.79 
 
 		 375 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.68 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.9 
 
 		 375 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  34.62 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 375 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 373 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  36.78 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 		 393 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  33.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35 
 
 		 375 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  34.09 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 358 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.76 
 
 		 384 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 358 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  32.5 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.95 
 
 		 358 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 383 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 379 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 379 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 383 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 383 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 379 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 375 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 383 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.26 
 
 		 360 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  30.49 
 
 		 185 aa  43.9  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2346  Chorismate mutase  33.8 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  30.68 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  33.8 
 
 		 359 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  36.07 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  29.41 
 
 		 366 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  34.88 
 
 		 105 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  33.8 
 
 		 359 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  29.41 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  29.27 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 377 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  30.43 
 
 		 366 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  32.56 
 
 		 384 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>