57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1875 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  100 
 
 		 97 aa  188  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  86.21 
 
 		 101 aa  146  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  79.79 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  79.79 
 
 		 108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  83.91 
 
 		 108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  36.05 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  34.07 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.76 
 
 		 358 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.95 
 
 		 358 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  29.67 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  36.05 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  38.81 
 
 		 375 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  36.59 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.95 
 
 		 358 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  29.67 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  28.57 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  31.76 
 
 		 391 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3126  chorismate mutase  39.29 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  36.47 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1451  chorismate mutase  29.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  29.27 
 
 		 346 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  33.33 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1353  chorismate mutase  34.52 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.397236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  36.71 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  32.89 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  30.12 
 
 		 399 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 		 375 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.41 
 
 		 391 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  32.1 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  27.06 
 
 		 375 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  37.66 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.06 
 
 		 375 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.86 
 
 		 295 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  31.33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.38 
 
 		 393 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  31.46 
 
 		 384 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  32.91 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.91 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.33 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.63 
 
 		 295 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  32.08 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  22.37 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  34.92 
 
 		 366 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  26.92 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  35.19 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  32.95 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0584  hypothetical protein  31.71 
 
 		 284 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1940  DAHP synthetase I/KDSA  27.03 
 
 		 363 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  28.24 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  32.18 
 
 		 397 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  29.63 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.73 
 
 		 384 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  27.38 
 
 		 662 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  32.35 
 
 		 366 aa  40  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  29.76 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  26.14 
 
 		 380 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>