263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1955 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  80.41 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  80.46 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  80.46 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  75.56 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1647  Chorismate mutase  72.45 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  71.11 
 
 		 90 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  69.23 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  53.16 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  46.15 
 
 		 370 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  44.87 
 
 		 359 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  39.51 
 
 		 381 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  43.04 
 
 		 387 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  43.04 
 
 		 382 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  42.68 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1243  Chorismate mutase  41.38 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1269  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44.44 
 
 		 358 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.76 
 
 		 359 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.76 
 
 		 359 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  38.1 
 
 		 377 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  42.31 
 
 		 374 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1647  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44.44 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.639332  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.18 
 
 		 360 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  39.02 
 
 		 372 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  37.8 
 
 		 419 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  41.18 
 
 		 355 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  42.68 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  34.62 
 
 		 366 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.59 
 
 		 360 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.65 
 
 		 368 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  36.25 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0727  chorismate mutase  46.15 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  34.57 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.82 
 
 		 358 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.77 
 
 		 355 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  43.21 
 
 		 706 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  40.74 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.96 
 
 		 413 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  32.91 
 
 		 371 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  39.02 
 
 		 391 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.91 
 
 		 371 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.64 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 357 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  32.1 
 
 		 365 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  35.8 
 
 		 360 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  34.12 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  35.37 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  41.46 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  35.8 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.65 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  34.12 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  35 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  32.93 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  37.35 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.37 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  40 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.37 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.37 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.62 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.84 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.78 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  34.15 
 
 		 379 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  32.05 
 
 		 366 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0956  chorismate mutase  40.45 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  35.9 
 
 		 359 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  36.56 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1161  chorismate mutase  33.73 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  34.62 
 
 		 359 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1297  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  32.93 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.25 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1572  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.829295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3343  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  29.63 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0697  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  32.1 
 
 		 360 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  37.23 
 
 		 362 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  40 
 
 		 355 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 373 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  32.95 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  37.35 
 
 		 357 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  33.33 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1792  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 		 363 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  40.24 
 
 		 418 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  28.57 
 
 		 360 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>