216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0727 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0727  chorismate mutase  100 
 
 
104 aa  196  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  50.55 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.78 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1647  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.91 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.639332  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1269  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.65 
 
 
358 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.45 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0697  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.17 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10140  chorismate mutase  38.89 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  43.21 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  34.52 
 
 
359 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  43.59 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1647  Chorismate mutase  43.96 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0947  Chorismate mutase  41.33 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000576924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  46.15 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2014  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  41.98 
 
 
358 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00348159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2734  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.47 
 
 
360 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1618  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  32.05 
 
 
350 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3343  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  37.04 
 
 
357 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  42.31 
 
 
382 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.51 
 
 
355 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  45.68 
 
 
362 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  43.06 
 
 
397 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2998  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.746769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2280  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2748  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.531887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2698  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2677  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.907033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2958  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  40 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2957  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.64747e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2960  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3004  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  39.51 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  38.61 
 
 
364 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  41.98 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  40 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  36.05 
 
 
355 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2751  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.27 
 
 
358 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  40 
 
 
360 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.62 
 
 
364 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  33.77 
 
 
371 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  44.93 
 
 
358 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  44.93 
 
 
358 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.94 
 
 
360 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  33.77 
 
 
371 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.95 
 
 
367 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.88 
 
 
381 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  32.95 
 
 
359 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.76 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  36.78 
 
 
363 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1827  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  25.88 
 
 
363 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  38.04 
 
 
402 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0956  chorismate mutase  39.02 
 
 
291 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1792  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  25.88 
 
 
363 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.62 
 
 
364 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.71 
 
 
364 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  34.02 
 
 
393 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  31.76 
 
 
360 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4791  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.57 
 
 
357 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  31.82 
 
 
359 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  37.65 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  38.04 
 
 
374 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.05 
 
 
370 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  38.04 
 
 
374 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.76 
 
 
360 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1572  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  40.51 
 
 
379 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.829295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  31.76 
 
 
360 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  36.96 
 
 
399 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  35.48 
 
 
373 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.65 
 
 
365 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  29.79 
 
 
371 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.79 
 
 
371 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.93 
 
 
357 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.47 
 
 
361 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  32.67 
 
 
365 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  35 
 
 
359 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  37.65 
 
 
391 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.93 
 
 
357 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.93 
 
 
357 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  35.29 
 
 
374 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.25 
 
 
362 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  42.25 
 
 
706 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  33.33 
 
 
358 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  33.66 
 
 
365 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  30.59 
 
 
360 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  30.86 
 
 
366 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  31.96 
 
 
393 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.59 
 
 
360 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  30.59 
 
 
360 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  35.62 
 
 
359 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  30.59 
 
 
360 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  32.58 
 
 
365 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  30.59 
 
 
360 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.03 
 
 
357 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>