109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0947 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0947  Chorismate mutase  100 
 
 
93 aa  190  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000576924 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10140  chorismate mutase  59.78 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1161  chorismate mutase  45 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0727  chorismate mutase  41.33 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  39.19 
 
 
359 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  33.78 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.1 
 
 
356 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  33.78 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1243  Chorismate mutase  42.31 
 
 
97 aa  53.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0956  chorismate mutase  42.11 
 
 
291 aa  53.5  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  38.16 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  31.08 
 
 
90 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  31.08 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  31.58 
 
 
360 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  31.08 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  32.14 
 
 
377 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  32.86 
 
 
360 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.05 
 
 
368 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.86 
 
 
360 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  34.09 
 
 
361 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  32.86 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  41.43 
 
 
360 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  32.43 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  36.49 
 
 
391 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.67 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.14 
 
 
358 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1618  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  40 
 
 
350 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  28.75 
 
 
382 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  32.86 
 
 
360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  40.28 
 
 
402 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  35.71 
 
 
359 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1647  Chorismate mutase  33.78 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.93 
 
 
362 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.86 
 
 
360 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  32.86 
 
 
362 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  35 
 
 
366 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  32.86 
 
 
360 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  32.86 
 
 
360 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  32.86 
 
 
360 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.26 
 
 
387 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 
358 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  28.75 
 
 
374 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  33.75 
 
 
372 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  37.14 
 
 
360 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  34.48 
 
 
379 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  30 
 
 
355 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.33 
 
 
381 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28.75 
 
 
370 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  31.43 
 
 
360 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2960  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2280  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  45.28 
 
 
374 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2751  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  33.33 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 
357 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.95 
 
 
360 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  29.76 
 
 
359 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  36.84 
 
 
397 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2734  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.67 
 
 
360 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2998  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.746769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2748  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.531887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2698  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2677  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.907033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2958  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  30.77 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.15 
 
 
374 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.15 
 
 
374 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3004  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2957  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.64747e-16 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  28.92 
 
 
706 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  30 
 
 
358 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0697  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  32 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  28.57 
 
 
359 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  32.43 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2014  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.49 
 
 
358 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  28.57 
 
 
366 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  27.03 
 
 
359 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  27.03 
 
 
359 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.83 
 
 
381 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  34.57 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  27.27 
 
 
365 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  27.63 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  28.75 
 
 
364 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.88 
 
 
475 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  28.09 
 
 
365 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  36.11 
 
 
399 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  30.67 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  30.23 
 
 
362 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  30 
 
 
371 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  29.41 
 
 
367 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  30.26 
 
 
358 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1269  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.77 
 
 
358 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  30 
 
 
419 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>