136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10140 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10140  chorismate mutase  100 
 
 
93 aa  188  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0947  Chorismate mutase  59.78 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000576924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  39.29 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0727  chorismate mutase  38.89 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.74 
 
 
359 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1161  chorismate mutase  38.1 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  47.3 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  41.86 
 
 
381 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.84 
 
 
387 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  34.57 
 
 
359 aa  60.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  41.43 
 
 
419 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  37.5 
 
 
373 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  36.47 
 
 
391 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1618  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  40.28 
 
 
350 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  36.49 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  40 
 
 
372 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.2 
 
 
360 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  38.2 
 
 
360 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  31.18 
 
 
359 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  35.9 
 
 
356 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1243  Chorismate mutase  42.86 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  35.8 
 
 
374 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  40.96 
 
 
366 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  36.49 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  40.54 
 
 
372 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  32.5 
 
 
382 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.67 
 
 
359 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  34.67 
 
 
359 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.67 
 
 
368 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.8 
 
 
370 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  30.11 
 
 
359 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  36.49 
 
 
371 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  36.49 
 
 
371 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  34.21 
 
 
360 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.08 
 
 
361 aa  53.9  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0956  chorismate mutase  37.35 
 
 
291 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.89 
 
 
360 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  32.89 
 
 
360 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  38.16 
 
 
706 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  35.14 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  35.14 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  33.78 
 
 
358 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1792  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.58 
 
 
363 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1827  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.58 
 
 
363 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.75 
 
 
366 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  41.98 
 
 
358 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  36.62 
 
 
360 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0046  chorismate mutase, putative  40.54 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  31.71 
 
 
362 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  31.71 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.93 
 
 
371 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  37.93 
 
 
371 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  31.71 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  35.14 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.71 
 
 
360 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  35.14 
 
 
98 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  31.71 
 
 
360 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  31.71 
 
 
360 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  31.71 
 
 
360 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2280  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  36.49 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2960  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  38.55 
 
 
365 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  37.84 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.72 
 
 
371 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2751  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  34.52 
 
 
413 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.21 
 
 
358 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2998  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.746769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2748  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.531887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2698  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2677  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.907033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2958  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2957  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.64747e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3004  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.53 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1297  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.26 
 
 
363 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 
357 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  30.12 
 
 
355 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.29 
 
 
358 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  38.55 
 
 
366 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 
357 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  34.21 
 
 
355 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 
357 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  34.88 
 
 
357 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  32.56 
 
 
357 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.67 
 
 
355 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  30.77 
 
 
365 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2014  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  33.33 
 
 
358 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  35.71 
 
 
360 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  37.18 
 
 
363 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  34.29 
 
 
121 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1647  Chorismate mutase  33.78 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>