162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0046 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0046  chorismate mutase, putative  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2904  Chorismate mutase  66.67 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2533  Chorismate mutase  68.93 
 
 		 108 aa  143  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  69.79 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  62.26 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2732  chorismate mutase  64.21 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0378476  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2121  chorismate mutase, putative  56.44 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  39.24 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  36.9 
 
 		 355 aa  60.1  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  38.27 
 
 		 357 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  42.67 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.35 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  39.29 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1243  Chorismate mutase  39.76 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1618  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  36.14 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  32.94 
 
 		 360 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 357 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  30 
 
 		 372 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  32.26 
 
 		 379 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  34.15 
 
 		 360 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.94 
 
 		 355 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  33.73 
 
 		 419 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.94 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  27.84 
 
 		 403 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10140  chorismate mutase  40.54 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  35.06 
 
 		 379 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  34.57 
 
 		 362 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  34.57 
 
 		 360 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.87 
 
 		 370 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  30.12 
 
 		 359 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.57 
 
 		 360 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 372 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  34.57 
 
 		 360 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  33.33 
 
 		 361 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  34.57 
 
 		 360 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  30.59 
 
 		 362 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  34.57 
 
 		 360 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  32.58 
 
 		 359 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 358 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  34.57 
 
 		 360 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  29.63 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28.05 
 
 		 387 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1792  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  29.27 
 
 		 363 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1827  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  29.27 
 
 		 363 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124092  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  33.71 
 
 		 359 aa  50.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  28.05 
 
 		 382 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1297  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.49 
 
 		 363 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0727  chorismate mutase  27.71 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  30.12 
 
 		 357 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  30.85 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0956  chorismate mutase  37.04 
 
 		 291 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  30.85 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  34.21 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 362 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  29.03 
 
 		 373 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  29.41 
 
 		 356 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  28.05 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.21 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  28.92 
 
 		 359 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.16 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1161  chorismate mutase  34.15 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  28.57 
 
 		 371 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  27.27 
 
 		 373 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  28.57 
 
 		 371 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  29.11 
 
 		 359 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  31.94 
 
 		 399 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 		 374 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  26.51 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  22.83 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  32.18 
 
 		 402 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2280  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102751 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2698  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2677  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.907033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2960  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  30.77 
 
 		 373 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 359 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2998  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.746769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2748  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.531887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2957  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.64747e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3004  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2958  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.59 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  26.09 
 
 		 364 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  32.56 
 
 		 648 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  26.44 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.92 
 
 		 367 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  33.33 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  29.49 
 
 		 365 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.09 
 
 		 371 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>