154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0808 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  94.24 
 
 
295 aa  531  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  78.64 
 
 
295 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  71.86 
 
 
294 aa  426  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  30.37 
 
 
218 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.37 
 
 
218 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  31.28 
 
 
223 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.86 
 
 
218 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  35.81 
 
 
234 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.91 
 
 
218 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  36.7 
 
 
517 aa  99.4  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.44 
 
 
218 aa  96.3  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34.43 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.53 
 
 
259 aa  89.4  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.88 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  32 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  31.69 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34.43 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  34.56 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  30.81 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.32 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0674  3-dehydroquinate dehydratase, putative  31.78 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.85 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  41.6 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.17 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  30.1 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  27.54 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.54 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  26.48 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  30.1 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  28.9 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  28.9 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  26.46 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.53 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  28.12 
 
 
225 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.33 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  28.44 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  28.44 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  28.44 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  26.9 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  28.96 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  30.41 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.96 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1870  3-dehydroquinate dehydratase  31.22 
 
 
204 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.438202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  28.96 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  31.96 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  28.44 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  28.96 
 
 
252 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  29.09 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  29.09 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  29.09 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  29.09 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  32.04 
 
 
526 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  32.54 
 
 
300 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  31.91 
 
 
473 aa  62.4  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  35 
 
 
226 aa  62.4  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  28.57 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  44.55 
 
 
224 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.37 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  30.41 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  28.5 
 
 
613 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  27.13 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  20.94 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  29.09 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  26.96 
 
 
1611 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.62 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  28.92 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  27.68 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  29.89 
 
 
197 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  32 
 
 
108 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 
374 aa  49.7  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  44.23 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  30.58 
 
 
234 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.54 
 
 
383 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  23 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  23 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.98 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.33 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  44.23 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.29 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  45.45 
 
 
397 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.36 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  45.31 
 
 
355 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.94 
 
 
383 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.94 
 
 
383 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.62 
 
 
358 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48 
 
 
373 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  44.23 
 
 
379 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  44.23 
 
 
379 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  44.23 
 
 
379 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  37.04 
 
 
355 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>