72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2188 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  53.2 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  54.4 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  54.4 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  54.4 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  54.4 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  52.8 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  52.8 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  52.8 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  52.8 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  52.4 
 
 		 252 aa  271  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  52.4 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  52 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  53.97 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  46.61 
 
 		 270 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  43.2 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  39.84 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  39.92 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  40.08 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34.92 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  41 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  43.08 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  39.29 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  41.96 
 
 		 277 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  35.17 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  33.05 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  35.62 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  34.29 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  32.5 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  32.5 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  31.28 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  34.12 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  35.06 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.15 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.65 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  29.63 
 
 		 293 aa  94.4  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.77 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.8 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  31.22 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.03 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  27.27 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  32.09 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  25.83 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  32.49 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  24.57 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  24.57 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  28.7 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  31.25 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  29.03 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  31.05 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  27.23 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  31.51 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.05 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  37.5 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.23 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  29.89 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  25.41 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  30.95 
 
 		 526 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  25.59 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  25.21 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  29.12 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  29.81 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  27.78 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  27.47 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10544  pentafunctional AROM polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06460)  27.03 
 
 		 688 aa  49.7  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.572044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  28.3 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.62 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1870  3-dehydroquinate dehydratase  26.27 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.438202 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  22.94 
 
 		 1611 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1285  3-dehydroquinate dehydratase, putative (AroD)  25.82 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>