17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1285 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1285  3-dehydroquinate dehydratase, putative (AroD)  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1870  3-dehydroquinate dehydratase  43.13 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.438202 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0674  3-dehydroquinate dehydratase, putative  33.49 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  27.93 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  26.27 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  28 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  28 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  25.71 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.25 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  26.54 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  27.92 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  26.44 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  24.37 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  24.74 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  25.82 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  27.07 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  23.56 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>