275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1164 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  82.59 
 
 		 379 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  91.8 
 
 		 379 aa  722    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.11 
 
 		 383 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  82.32 
 
 		 383 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.38 
 
 		 379 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.38 
 
 		 379 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.11 
 
 		 379 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 379 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  82.85 
 
 		 379 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  82.85 
 
 		 383 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  82.85 
 
 		 383 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.51 
 
 		 384 aa  688    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  82.54 
 
 		 384 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  81.75 
 
 		 383 aa  621  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  76.98 
 
 		 379 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  72.41 
 
 		 384 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.46 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  59.19 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.06 
 
 		 373 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.19 
 
 		 375 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  57.8 
 
 		 373 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.06 
 
 		 373 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 373 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  57.8 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.64 
 
 		 375 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.99 
 
 		 373 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.49 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.72 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.16 
 
 		 374 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50.27 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.35 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.46 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  40.34 
 
 		 706 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  35.64 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  34.34 
 
 		 274 aa  166  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  34.62 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 283 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  32.81 
 
 		 274 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  32.61 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  29.49 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  31.5 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  31.36 
 
 		 242 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  31.62 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  27.39 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  29.8 
 
 		 292 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  25.2 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  26.48 
 
 		 258 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 263 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.63 
 
 		 346 aa  90.1  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  25.79 
 
 		 262 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  33.18 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  21.85 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  24.16 
 
 		 294 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  26.78 
 
 		 259 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  26.46 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  21.91 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  21.28 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  29.38 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  21.55 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  24.28 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  23.5 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  23.27 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  20.77 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  24.45 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.56 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  25.99 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  22.5 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  24.89 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  25.75 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.55 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  30.91 
 
 		 243 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 252 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  29.95 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>