162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0118 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
262 aa  533  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  50.2 
 
 
263 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  51 
 
 
258 aa  241  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  49.4 
 
 
292 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  48.8 
 
 
259 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  47.81 
 
 
260 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  32.56 
 
 
276 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
379 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.27 
 
 
377 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.17 
 
 
383 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 
379 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 
379 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 
373 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.98 
 
 
384 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.09 
 
 
379 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.27 
 
 
379 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.06 
 
 
373 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 
384 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 
373 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.64 
 
 
384 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 
375 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 
373 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 
373 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.48 
 
 
383 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.87 
 
 
375 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.09 
 
 
383 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.66 
 
 
373 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.69 
 
 
379 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.69 
 
 
383 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 
379 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.14 
 
 
372 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  24.61 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.69 
 
 
383 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  24.61 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 
505 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.33 
 
 
375 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  26.5 
 
 
375 aa  89.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 
375 aa  89.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.79 
 
 
379 aa  89  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.75 
 
 
373 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.75 
 
 
373 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 
283 aa  85.1  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 
384 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 
371 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  31.31 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.16 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  27.57 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  24.49 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  33.33 
 
 
706 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  26.29 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  29.32 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  24.9 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  27.56 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  26.25 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  28.1 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  25.2 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  25.37 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  23.5 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  22.82 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  31.22 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  25.79 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  25 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  23.86 
 
 
258 aa  55.5  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.82 
 
 
742 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.89 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.24 
 
 
308 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  25 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  24.05 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  29.46 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  25 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  25 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.08 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.73 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>