131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1785 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
250 aa  497  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  87.15 
 
 
250 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  72.98 
 
 
250 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  69.6 
 
 
253 aa  362  4e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  27.46 
 
 
351 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  28.9 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  35.92 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.19 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  26.34 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  25.33 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  28.85 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  27.18 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  24.32 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  28.68 
 
 
439 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
274 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  24.35 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  25.55 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  25.79 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
373 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 
374 aa  55.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.88 
 
 
735 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  26.62 
 
 
443 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 
371 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  23.57 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  27.54 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  27.65 
 
 
447 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  25.9 
 
 
439 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  28.89 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  25.97 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  25.18 
 
 
443 aa  52  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
373 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
373 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
373 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.72 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  24.12 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.12 
 
 
375 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.95 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  26.44 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  26.64 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.21 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  27.98 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.19 
 
 
313 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.59 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.47 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  25.75 
 
 
313 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  25.97 
 
 
742 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.32 
 
 
307 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.78 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 
373 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
373 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
373 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  26.7 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  27.75 
 
 
373 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  27.42 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  28.49 
 
 
339 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  25.67 
 
 
746 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
384 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  27.75 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  25.79 
 
 
534 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
373 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.57 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.14 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23.51 
 
 
748 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  21.71 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  24.68 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  24.02 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 
374 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.72 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  21.51 
 
 
275 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.93 
 
 
312 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  36.36 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  23.98 
 
 
290 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  26.5 
 
 
287 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.02 
 
 
373 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  25.43 
 
 
375 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.89 
 
 
384 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.24 
 
 
314 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  25.09 
 
 
750 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>