More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2225 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  80.16 
 
 
276 aa  443  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  63.42 
 
 
276 aa  354  6.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  61.48 
 
 
276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  56.16 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  56.88 
 
 
275 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  56.52 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  55.8 
 
 
275 aa  292  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  50.58 
 
 
275 aa  285  4e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  49.64 
 
 
276 aa  285  8e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
284 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  38.13 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  37.28 
 
 
280 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  37.63 
 
 
285 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  37.77 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  38.79 
 
 
285 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  36.74 
 
 
280 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  33.1 
 
 
292 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 
292 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
294 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
294 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  35 
 
 
292 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
319 aa  161  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.97 
 
 
311 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  31.18 
 
 
294 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  35.38 
 
 
293 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
290 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  31.9 
 
 
300 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
292 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  31.54 
 
 
318 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 
299 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.82 
 
 
313 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  34.29 
 
 
367 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.65 
 
 
742 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  28.83 
 
 
293 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.36 
 
 
746 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.47 
 
 
310 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
534 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.8 
 
 
298 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.04 
 
 
770 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 
286 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.54 
 
 
311 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.5 
 
 
312 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.36 
 
 
311 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  29.71 
 
 
288 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.36 
 
 
311 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  34 
 
 
298 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.11 
 
 
310 aa  141  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.32 
 
 
735 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  31.68 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.81 
 
 
750 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.03 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.94 
 
 
748 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 
288 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  31.18 
 
 
320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  31.08 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 
366 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 
378 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 
366 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.29 
 
 
367 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  31.91 
 
 
302 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.05 
 
 
746 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.41 
 
 
746 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 
367 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 
293 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.06 
 
 
301 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.05 
 
 
746 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.57 
 
 
293 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.57 
 
 
293 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  30.91 
 
 
290 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  31.91 
 
 
298 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
286 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.05 
 
 
746 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 
280 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.39 
 
 
780 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  31.36 
 
 
366 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 
378 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  30.91 
 
 
535 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 
312 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
366 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.78 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.66 
 
 
364 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  28.32 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.32 
 
 
746 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  29.6 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.03 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
363 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.68 
 
 
778 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
363 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  30.89 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 
298 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>