More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0125 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  98.18 
 
 		 275 aa  553  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  98.91 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  63.28 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  61.48 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  61.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  56.88 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  53.31 
 
 		 276 aa  290  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  51.56 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  49.45 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  37.77 
 
 		 284 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  40.85 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  37.1 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  37.14 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  36.82 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  35.11 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  35.36 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.58 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.29 
 
 		 742 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  31.18 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  27.5 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.78 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.75 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.03 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.32 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.32 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.01 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  31.41 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  30.6 
 
 		 367 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.16 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 368 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.24 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.06 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.42 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  31.41 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.24 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.76 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  28.32 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.24 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  28.84 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.39 
 
 		 746 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.07 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.98 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.67 
 
 		 735 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  30.28 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  29.72 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.32 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  31.75 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  32.32 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  28.31 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.24 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  27.34 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 367 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.06 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.76 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  31.01 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.56 
 
 		 770 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.42 
 
 		 750 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  32.2 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  28.98 
 
 		 534 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.41 
 
 		 778 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.24 
 
 		 308 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.54 
 
 		 746 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.89 
 
 		 745 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>