297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10360 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  587  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  37.82 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 		 742 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.52 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 		 373 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  31.12 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  31.6 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  32.18 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  31.14 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.82 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  32.46 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  29.07 
 
 		 356 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.8 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  31.29 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.82 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.54 
 
 		 748 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.85 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.88 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  31.21 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  32.17 
 
 		 362 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  29.66 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.85 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  31.91 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.43 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.43 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.77 
 
 		 750 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  30.65 
 
 		 364 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.66 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.38 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  35.32 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 275 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  30.51 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.53 
 
 		 735 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.57 
 
 		 746 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.79 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.08 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  30.74 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.53 
 
 		 746 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.8 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  27.08 
 
 		 534 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  31.47 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.22 
 
 		 746 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 366 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  30.1 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.57 
 
 		 746 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  33.6 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  30.74 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 		 378 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.79 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.57 
 
 		 752 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  30.51 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  30.51 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  29.13 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>