280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1203 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  39.18 
 
 
369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
288 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.43 
 
 
748 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  36.19 
 
 
293 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  36.19 
 
 
293 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  37.59 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  35.47 
 
 
284 aa  178  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.82 
 
 
299 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  36.86 
 
 
367 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  37.08 
 
 
366 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.88 
 
 
742 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
290 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  38 
 
 
366 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  38 
 
 
378 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  38 
 
 
366 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  38 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  35.36 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.34 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  37.07 
 
 
364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 
366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  37.08 
 
 
366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  38 
 
 
378 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  40.22 
 
 
281 aa  171  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  37.15 
 
 
366 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  35.5 
 
 
279 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  39.57 
 
 
270 aa  169  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 
288 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  38.68 
 
 
275 aa  169  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  34.59 
 
 
297 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 
286 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  34.43 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  34.23 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.94 
 
 
287 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  37.75 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.57 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  36.76 
 
 
367 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.25 
 
 
746 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  30.26 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.59 
 
 
746 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.36 
 
 
746 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.86 
 
 
735 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.22 
 
 
746 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.21 
 
 
746 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  31.42 
 
 
370 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  32.94 
 
 
339 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.97 
 
 
373 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 
356 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  30.82 
 
 
301 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.31 
 
 
311 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 
286 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
286 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 
293 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  33.72 
 
 
328 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 
297 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.2 
 
 
750 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  33.93 
 
 
298 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 
300 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 
364 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  33.98 
 
 
535 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 
534 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  35 
 
 
367 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.59 
 
 
307 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  38.06 
 
 
363 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  38.06 
 
 
363 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  38.8 
 
 
276 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  31.16 
 
 
292 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.69 
 
 
746 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  31.52 
 
 
294 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
361 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  36.65 
 
 
365 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
293 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  34 
 
 
290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.95 
 
 
778 aa  155  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 
369 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.58 
 
 
780 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  32.77 
 
 
375 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.23 
 
 
319 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.43 
 
 
308 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 
280 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
292 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.51 
 
 
746 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
291 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.05 
 
 
308 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  30.89 
 
 
286 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  37.74 
 
 
280 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.82 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  33.46 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  35.87 
 
 
362 aa  152  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 
275 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.77 
 
 
311 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.77 
 
 
311 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  37.86 
 
 
290 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 
293 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  35.22 
 
 
301 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  32.57 
 
 
322 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  30.45 
 
 
307 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  30.3 
 
 
286 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>