273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1058 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  40.22 
 
 		 280 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  36.46 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.66 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.69 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  31.99 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 		 367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  33.82 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  32.41 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  27.82 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  32.31 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  32.31 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  32.31 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.5 
 
 		 770 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.21 
 
 		 742 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 		 366 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  30 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 		 369 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.64 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  28.83 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.64 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  31.83 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  29.39 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  31.51 
 
 		 366 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  28.95 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  30.95 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  26.26 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.53 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 		 379 aa  122  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 		 361 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.37 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.26 
 
 		 745 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.29 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  28.01 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  32.58 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.6 
 
 		 748 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1832  Prephenate dehydrogenase  27.82 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  30.3 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  32.6 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.07 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  31.41 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  31.63 
 
 		 366 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  31.63 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  27.4 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.86 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.85 
 
 		 780 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  27.4 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.11 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2408  Prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  29.96 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.86 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 		 367 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  26.86 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 312 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.35 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  28.04 
 
 		 361 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 		 369 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  35.59 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  27.49 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>