More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0659 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
276 aa  558  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  56.64 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  51.75 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  50.19 
 
 
276 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  48.25 
 
 
276 aa  259  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  49.64 
 
 
276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  49.45 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  48.73 
 
 
275 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  49.09 
 
 
275 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  47.22 
 
 
275 aa  236  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  35.48 
 
 
284 aa  204  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  38.69 
 
 
279 aa  191  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  37.99 
 
 
280 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  36.56 
 
 
282 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  37.59 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  40 
 
 
285 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  34.64 
 
 
285 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
288 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  34.07 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  32.83 
 
 
294 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 
288 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  32.23 
 
 
290 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  32.83 
 
 
294 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
292 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 
319 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.09 
 
 
307 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.37 
 
 
313 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  29.62 
 
 
293 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 
302 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.22 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  32.44 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  33.84 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  29.85 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.42 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.34 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.7 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  32.71 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  32.96 
 
 
334 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.4 
 
 
742 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
309 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  32.32 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  31.37 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.8 
 
 
311 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 
313 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.29 
 
 
311 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  32.42 
 
 
289 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.95 
 
 
298 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.32 
 
 
750 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.25 
 
 
311 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
291 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.13 
 
 
299 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.7 
 
 
311 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  30.31 
 
 
296 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.43 
 
 
313 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  31.78 
 
 
288 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  32.58 
 
 
302 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.52 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.41 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  32.18 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  28.73 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  33.72 
 
 
364 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.66 
 
 
314 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.41 
 
 
770 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  30.35 
 
 
293 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  30.35 
 
 
293 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.18 
 
 
286 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.62 
 
 
311 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  32.33 
 
 
329 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  32.33 
 
 
329 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 
293 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  31.09 
 
 
298 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.27 
 
 
312 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  32.33 
 
 
322 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  30.38 
 
 
294 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.89 
 
 
746 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.06 
 
 
746 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.04 
 
 
778 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.12 
 
 
735 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  28.29 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.12 
 
 
746 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.12 
 
 
746 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  32.58 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  29.8 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  29.5 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.03 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.32 
 
 
748 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  29.8 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
534 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  30 
 
 
293 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  30.47 
 
 
286 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 
313 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.95 
 
 
745 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
365 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>