297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2500 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 361 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  49.02 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  44.94 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  50.14 
 
 		 369 aa  275  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  49.31 
 
 		 388 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  45.22 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  48.18 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  46.29 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  44.54 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  42.98 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  46.29 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  44.07 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  42.93 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  43.18 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  46.63 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  38.59 
 
 		 370 aa  189  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  41.23 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  36.62 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  38.21 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  42.7 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  38.02 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  34.8 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  39.78 
 
 		 285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  35.47 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  42.18 
 
 		 292 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  37.32 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  34.07 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  29 
 
 		 280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  35.56 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  36.03 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.59 
 
 		 750 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.81 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  35.99 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.22 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.22 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  35.31 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.85 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.63 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  36.76 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  23.76 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.21 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.96 
 
 		 746 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  27.22 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  36.21 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  26.97 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.42 
 
 		 373 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  26.97 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  35.25 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  26.97 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.06 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  26.97 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.94 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  33.77 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  36.07 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  37.93 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  36.57 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  35.64 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  33.83 
 
 		 293 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  36.33 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  32.18 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37 
 
 		 746 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.39 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.02 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  28.36 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.79 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  26.36 
 
 		 369 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.4 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.4 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  32.88 
 
 		 278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  33.79 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.63 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.63 
 
 		 746 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.63 
 
 		 746 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  35.19 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  35.97 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.87 
 
 		 735 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.36 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  32.43 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  35.22 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.61 
 
 		 746 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>