266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5060 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 396 aa  769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  76.44 
 
 		 370 aa  547  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  43.75 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  43.84 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  40.45 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  42.09 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  43.26 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  39.17 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  40.65 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  38.95 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  40.92 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  38.5 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 370 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  39.1 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  36.62 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  38.95 
 
 		 369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  37.09 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  37.98 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  42.46 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  41.18 
 
 		 283 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  33.51 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  30.89 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.53 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  29.06 
 
 		 280 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  37.45 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  30.95 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 291 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.31 
 
 		 750 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  31.95 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  30.3 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.08 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.96 
 
 		 293 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.96 
 
 		 293 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.74 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.22 
 
 		 746 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.29 
 
 		 770 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  24.81 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  28.91 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  29.8 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.06 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  26.49 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.32 
 
 		 286 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 293 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 294 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.44 
 
 		 746 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.55 
 
 		 746 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  26.87 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  24.69 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  25.89 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.03 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.11 
 
 		 746 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  25.89 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  28.67 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.51 
 
 		 778 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.31 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  32.21 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.89 
 
 		 746 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 292 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  34.3 
 
 		 289 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  25.89 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.6 
 
 		 312 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.67 
 
 		 288 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  28.46 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.25 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  25.52 
 
 		 280 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  31.91 
 
 		 312 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 		 297 aa  99.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  33.47 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 		 285 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 		 297 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  26.81 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 		 329 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 		 308 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 		 329 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 		 292 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.74 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 313 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.44 
 
 		 746 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.99 
 
 		 742 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>