277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1495 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  698    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  73.94 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  58.99 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  63.08 
 
 		 357 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  57.14 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  51.53 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  45.74 
 
 		 369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  51.68 
 
 		 370 aa  285  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  49.86 
 
 		 388 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  48.61 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  44.48 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  46.28 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  46.29 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  44.38 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  56.27 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  44.6 
 
 		 369 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  43.84 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  47.37 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  40.66 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  51.99 
 
 		 283 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  35.89 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.93 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  34.23 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  31.09 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.72 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  28.02 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.38 
 
 		 312 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  32.9 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  33.78 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  37.8 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  37.28 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  37.28 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.54 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.54 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  35.4 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.95 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  28.82 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  36.12 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.86 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  37.19 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  28.45 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.57 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  31.46 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  39.66 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.86 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.91 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  36.36 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  35.46 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  36.12 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  34.78 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 		 282 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.47 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.87 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  36.12 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.61 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.53 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  35.09 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.36 
 
 		 746 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.17 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.01 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.6 
 
 		 286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.7 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  33.33 
 
 		 535 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  33.94 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  33.47 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.98 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  37.3 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  25.81 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.78 
 
 		 746 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 		 750 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  38.03 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  34.27 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 534 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.79 
 
 		 301 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  37.61 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  34.78 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.6 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.25 
 
 		 770 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  37.34 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  25.16 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  34.27 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>