268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0978 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  739    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  67.66 
 
 
355 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  58.24 
 
 
363 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  60.54 
 
 
357 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  51.22 
 
 
361 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  57.26 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  49.17 
 
 
369 aa  279  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  47.8 
 
 
370 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  43.6 
 
 
369 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  47.17 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  41.92 
 
 
369 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  43.49 
 
 
371 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  52.6 
 
 
283 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  54.61 
 
 
292 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  43.75 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  46.71 
 
 
369 aa  225  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  40.71 
 
 
386 aa  222  9e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  40.65 
 
 
396 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  39.14 
 
 
370 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  43.51 
 
 
369 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  35.48 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 
280 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.53 
 
 
373 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  27.32 
 
 
367 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.38 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  30.47 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  26.18 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.45 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.26 
 
 
288 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 
369 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  35.18 
 
 
290 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.15 
 
 
321 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.15 
 
 
321 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  38.91 
 
 
302 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
286 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.7 
 
 
307 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  31.19 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.18 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  36.76 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  26.38 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  30.57 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  38.89 
 
 
298 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.5 
 
 
746 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  32.22 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  32.38 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  39.33 
 
 
298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  36.59 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  38.72 
 
 
292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.4 
 
 
735 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.77 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  35.83 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  35.83 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
319 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  28.53 
 
 
366 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  35.14 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 
366 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 
378 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  28.49 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.52 
 
 
366 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.71 
 
 
301 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  29.52 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  36.86 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  29.52 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.02 
 
 
746 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.42 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.62 
 
 
746 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 
291 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
288 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  26.26 
 
 
280 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  37.21 
 
 
329 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  37.21 
 
 
329 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  40.31 
 
 
348 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 
301 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.71 
 
 
298 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.62 
 
 
746 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.61 
 
 
746 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  36.55 
 
 
290 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.27 
 
 
299 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 
281 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  37.45 
 
 
302 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  26.78 
 
 
369 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  32.01 
 
 
360 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.83 
 
 
742 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.87 
 
 
746 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  37.21 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  33.24 
 
 
364 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35 
 
 
746 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  34.2 
 
 
301 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  31.13 
 
 
318 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 
287 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>