More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1182 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 364 aa  721    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  52.6 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  47.53 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  50 
 
 		 375 aa  302  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  43.29 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  41.73 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  46.1 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  35.2 
 
 		 367 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  38.16 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  41 
 
 		 334 aa  249  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  36.77 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  36.77 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  36.77 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  42.9 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  36.49 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  36.49 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  36.57 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  36.49 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  36.21 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  35.93 
 
 		 378 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  42.96 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  35.93 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  41.34 
 
 		 286 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  42.61 
 
 		 286 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  42.7 
 
 		 288 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  40.39 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  41.7 
 
 		 290 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  41.9 
 
 		 287 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  38.35 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  39.22 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  39.64 
 
 		 288 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  40.89 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.26 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  43.28 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.93 
 
 		 311 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  41.67 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  39.93 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  39.93 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  41.87 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  42.76 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.79 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  31.55 
 
 		 362 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  39.64 
 
 		 300 aa  209  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  41.22 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  42.55 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  40.7 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  43.25 
 
 		 295 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.46 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.1 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  36.02 
 
 		 379 aa  206  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 301 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.58 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.46 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.44 
 
 		 313 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.73 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  39.86 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.73 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  40.51 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.89 
 
 		 746 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.73 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  33.89 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.32 
 
 		 311 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  40.51 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  37.29 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.44 
 
 		 314 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  39.22 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.68 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  37.59 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.38 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.54 
 
 		 742 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.03 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  40.84 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.03 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.38 
 
 		 311 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  37.86 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.38 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  40.46 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  38.79 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.66 
 
 		 746 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  40.28 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.31 
 
 		 735 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  38.82 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.19 
 
 		 746 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  38.85 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.7 
 
 		 752 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.54 
 
 		 746 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  37.14 
 
 		 292 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  39.15 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.62 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  38.43 
 
 		 318 aa  189  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  36.52 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.34 
 
 		 746 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.34 
 
 		 746 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  36.79 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>