286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4139 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  82.56 
 
 
361 aa  507  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  43.18 
 
 
329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  35.87 
 
 
290 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  41.03 
 
 
334 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.3 
 
 
735 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  37.32 
 
 
289 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.2 
 
 
746 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  35.69 
 
 
364 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  36.95 
 
 
356 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.2 
 
 
746 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.64 
 
 
746 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.86 
 
 
746 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
299 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  37.97 
 
 
293 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  43.62 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 
292 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  34.78 
 
 
293 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 
300 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  34.06 
 
 
292 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  34.06 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.64 
 
 
752 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  35.79 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  35.56 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 
363 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 
363 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.62 
 
 
746 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.97 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.97 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.3 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  37.1 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.27 
 
 
746 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  35.77 
 
 
288 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 
294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 
294 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  35.15 
 
 
534 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  32.48 
 
 
334 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 
280 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  35.38 
 
 
292 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
286 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 
286 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  35.4 
 
 
298 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.62 
 
 
746 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  33.93 
 
 
287 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.69 
 
 
742 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 
312 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  36.43 
 
 
309 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  35.41 
 
 
322 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  33.73 
 
 
361 aa  122  8e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.81 
 
 
310 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.11 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  36.55 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  34.46 
 
 
535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  36.96 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.96 
 
 
748 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  35.33 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  39.09 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  45.5 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  34.53 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.96 
 
 
308 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 
307 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.98 
 
 
366 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 
286 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  35.36 
 
 
302 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  40.4 
 
 
312 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 
286 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.63 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.57 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  34.65 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  34.65 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 
378 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  34.11 
 
 
308 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 
334 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.16 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  34.32 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  36.43 
 
 
313 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  26.48 
 
 
280 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  34.47 
 
 
302 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32 
 
 
778 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.88 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  42 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  34.29 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31 
 
 
780 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  29.29 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.52 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  34.16 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>