271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4050 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 322 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  53.18 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  53.18 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  53.18 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  52.72 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  53.57 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  51.14 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  51.61 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  47.76 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  47.47 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  31.53 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  37.67 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  40.2 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 		 348 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  37.62 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.22 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  39.24 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  37.1 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.36 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.11 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  37.31 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.59 
 
 		 746 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  36.29 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  35.86 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  28.85 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.99 
 
 		 735 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.56 
 
 		 746 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.56 
 
 		 746 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.56 
 
 		 746 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  36.61 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  28.46 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.56 
 
 		 746 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  33.56 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 534 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  27.24 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  36.63 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  33.67 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  30.87 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  28.08 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  36.24 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  36.07 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.62 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  25.1 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  34.01 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.15 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  26.69 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  33.85 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.65 
 
 		 750 aa  96.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  35.5 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  35.5 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  33.77 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.22 
 
 		 746 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.07 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  30.52 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  35.53 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  33.06 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  33.06 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  32.92 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  42.04 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  31.03 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.19 
 
 		 746 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.51 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  35.48 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.17 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  31.46 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  32.1 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  35.91 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  29.53 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  33.6 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>