276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0385 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  607  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  78.2 
 
 
291 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  70.5 
 
 
314 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  51.91 
 
 
291 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  51.53 
 
 
291 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  52.31 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  45.98 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  45.98 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  45.59 
 
 
284 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  35.25 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  46.18 
 
 
323 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  36.54 
 
 
279 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  42.16 
 
 
289 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  35.77 
 
 
279 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  35 
 
 
279 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  44.27 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  40.38 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  40.93 
 
 
278 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.15 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.21 
 
 
746 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.21 
 
 
746 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.63 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  37.13 
 
 
360 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.5 
 
 
313 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  35.34 
 
 
367 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  30.34 
 
 
297 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  35 
 
 
286 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.29 
 
 
308 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  31.91 
 
 
288 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.51 
 
 
746 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 
286 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  34.35 
 
 
286 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.44 
 
 
746 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  28.06 
 
 
282 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  39.08 
 
 
318 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  33.44 
 
 
307 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  35.14 
 
 
534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.97 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.74 
 
 
746 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.98 
 
 
311 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  37.31 
 
 
370 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.98 
 
 
311 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.02 
 
 
746 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.62 
 
 
750 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 
313 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.63 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.9 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.28 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.18 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 
285 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
286 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 
319 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  33.68 
 
 
535 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  33.07 
 
 
375 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
280 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  27.88 
 
 
368 aa  116  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.97 
 
 
311 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  35.98 
 
 
364 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  34.43 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.21 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.79 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.65 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.15 
 
 
735 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  26.62 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  22.88 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.55 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.32 
 
 
313 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 
301 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.45 
 
 
310 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.19 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  24.47 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  36.13 
 
 
334 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  28.88 
 
 
280 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 
302 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.06 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  29.06 
 
 
366 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  29.06 
 
 
366 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 
303 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.92 
 
 
746 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  35.17 
 
 
290 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  37.02 
 
 
388 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.72 
 
 
748 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 
295 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>