289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2701 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  59 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  59 
 
 		 278 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  56.15 
 
 		 284 aa  318  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  55.6 
 
 		 278 aa  310  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  56.87 
 
 		 289 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  53.26 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  50.21 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  41.88 
 
 		 308 aa  211  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  40.54 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  39.23 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  38.4 
 
 		 314 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  39.77 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  35 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  33.85 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  34.1 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  37.89 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  37.86 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.88 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  34.55 
 
 		 370 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.26 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.34 
 
 		 364 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  32.23 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.65 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  31.9 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  30.82 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.45 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.45 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 		 375 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  30.95 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.71 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  31.46 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  31.93 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.03 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.96 
 
 		 746 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.39 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.85 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  29.72 
 
 		 334 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 		 367 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  34.98 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  30.07 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  36.51 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  31.68 
 
 		 365 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  33.46 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  35.56 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.2 
 
 		 360 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.83 
 
 		 746 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  31.72 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  32.96 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 		 379 aa  122  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.57 
 
 		 748 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.21 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  31.42 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  31.16 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 		 534 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.93 
 
 		 745 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.29 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.29 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.27 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.29 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.86 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  27.02 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  32.61 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  29.26 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.83 
 
 		 746 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>