290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2114 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  39.72 
 
 
301 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  39.72 
 
 
291 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.35 
 
 
313 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.99 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.99 
 
 
313 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.71 
 
 
311 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.15 
 
 
310 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.6 
 
 
313 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.63 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  40.43 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  36.43 
 
 
320 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  40.57 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  40.29 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.32 
 
 
746 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.93 
 
 
298 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.69 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  41.43 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  37.99 
 
 
313 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.91 
 
 
314 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  40.5 
 
 
367 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.32 
 
 
746 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  39.84 
 
 
286 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 
301 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.97 
 
 
746 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  38.7 
 
 
286 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1832  Prephenate dehydrogenase  36.17 
 
 
302 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.2 
 
 
735 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.74 
 
 
310 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.17 
 
 
321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.81 
 
 
321 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.62 
 
 
746 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.46 
 
 
312 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  39.22 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  36.33 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  35.04 
 
 
299 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.63 
 
 
746 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  40.4 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.82 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  37.93 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.38 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 
322 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  39.08 
 
 
308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.92 
 
 
746 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  32.48 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  37.91 
 
 
312 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  35.21 
 
 
292 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  36.56 
 
 
535 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.41 
 
 
313 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.55 
 
 
311 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.82 
 
 
311 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
313 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  38.68 
 
 
329 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  36.82 
 
 
307 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  38.68 
 
 
329 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.82 
 
 
311 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  35.41 
 
 
317 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  36.82 
 
 
309 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  35.14 
 
 
318 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.2 
 
 
752 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  38.57 
 
 
291 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.85 
 
 
307 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  35.17 
 
 
334 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  38.72 
 
 
298 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  35.84 
 
 
534 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.4 
 
 
312 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  35.11 
 
 
297 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.07 
 
 
746 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  37.97 
 
 
302 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  39.38 
 
 
329 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  35.34 
 
 
290 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  38.03 
 
 
308 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.02 
 
 
311 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.85 
 
 
308 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35 
 
 
742 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  34.59 
 
 
289 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  38.84 
 
 
375 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  37.59 
 
 
312 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  31 
 
 
280 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.79 
 
 
748 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
364 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  36.3 
 
 
288 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  38.57 
 
 
298 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  37.59 
 
 
312 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  33.95 
 
 
294 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  36.68 
 
 
292 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  38.03 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.21 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  36.18 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0696  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.16 
 
 
317 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 
290 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.62 
 
 
292 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 
319 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 
285 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  36.18 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.52 
 
 
750 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 
302 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>