More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1832 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1832  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  64.51 
 
 
301 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  54.79 
 
 
313 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  57.04 
 
 
313 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  56.46 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  57.34 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  53.95 
 
 
320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  57.69 
 
 
312 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  56.99 
 
 
312 aa  305  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  53.98 
 
 
311 aa  304  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  55.94 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  52.74 
 
 
311 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  53.95 
 
 
319 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  52.23 
 
 
313 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  52.25 
 
 
311 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  52.25 
 
 
308 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  49.48 
 
 
321 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  49.48 
 
 
321 aa  299  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  50.52 
 
 
307 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  49.13 
 
 
312 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  51.89 
 
 
313 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  50.86 
 
 
313 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  51.2 
 
 
314 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  51.89 
 
 
314 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  51.52 
 
 
318 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  50.17 
 
 
308 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  53.29 
 
 
301 aa  291  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  51.16 
 
 
298 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  50 
 
 
312 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  48.63 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  48.62 
 
 
311 aa  281  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  46.74 
 
 
313 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  48.28 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  48.28 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  50.4 
 
 
317 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  48.62 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  47.9 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0696  cyclohexadienyl dehydrogenase  51.15 
 
 
317 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2888  cyclohexadienyl dehydrogenase  49.31 
 
 
300 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  41.13 
 
 
288 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  41.2 
 
 
286 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  39.5 
 
 
286 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  43.08 
 
 
290 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  38.89 
 
 
288 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 
286 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  39.76 
 
 
286 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  41.55 
 
 
746 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  40.14 
 
 
292 aa  195  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  43.77 
 
 
735 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  39.49 
 
 
286 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  41.55 
 
 
746 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  42.36 
 
 
534 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  41.36 
 
 
535 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  40 
 
 
770 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  40 
 
 
746 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  38.18 
 
 
297 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  41.55 
 
 
285 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  39.32 
 
 
293 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  39.32 
 
 
293 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.66 
 
 
746 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  40.2 
 
 
746 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.32 
 
 
746 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.66 
 
 
746 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.46 
 
 
742 aa  185  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  38 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  40.77 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  37.41 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  36.04 
 
 
294 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  41.33 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  39.72 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  37.58 
 
 
290 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  36.39 
 
 
319 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  36.17 
 
 
364 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.7 
 
 
752 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  35.17 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  34.42 
 
 
293 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.79 
 
 
748 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.81 
 
 
750 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.29 
 
 
780 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  35.34 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.94 
 
 
375 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  36.13 
 
 
300 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  39.92 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  38.02 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 
294 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  34.63 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 
286 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 
285 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  36.71 
 
 
298 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  40.47 
 
 
308 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  36.32 
 
 
290 aa  159  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  34.98 
 
 
290 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.49 
 
 
778 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  38 
 
 
293 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  40.08 
 
 
329 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  37.77 
 
 
292 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  40.08 
 
 
329 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  39.13 
 
 
302 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>