More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1748 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  100 
 
 
535 aa  1055    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  87.1 
 
 
534 aa  886    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  72.3 
 
 
735 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  70.98 
 
 
746 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  69.27 
 
 
746 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  69.09 
 
 
746 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  69.09 
 
 
746 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  66.84 
 
 
746 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  66.41 
 
 
746 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  66.15 
 
 
746 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  77.26 
 
 
752 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  49.09 
 
 
742 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  45.5 
 
 
750 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  50.87 
 
 
748 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  49.64 
 
 
286 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  55.12 
 
 
285 aa  286  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  51.59 
 
 
290 aa  282  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  50.7 
 
 
286 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  47.95 
 
 
770 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  50.17 
 
 
291 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  52.6 
 
 
296 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  48.97 
 
 
292 aa  263  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  41.99 
 
 
778 aa  259  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  41.12 
 
 
780 aa  259  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  48.76 
 
 
293 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  43.07 
 
 
745 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  44.52 
 
 
293 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  44.52 
 
 
293 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  47.16 
 
 
289 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  48.79 
 
 
295 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  45.61 
 
 
286 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  47.37 
 
 
290 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  45.14 
 
 
288 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  49.47 
 
 
288 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.61 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  48.77 
 
 
313 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  47.52 
 
 
311 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  49.48 
 
 
308 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  41.16 
 
 
319 aa  232  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.49 
 
 
314 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.99 
 
 
311 aa  232  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  46.26 
 
 
334 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  44.68 
 
 
288 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  44.56 
 
 
286 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.39 
 
 
311 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  47.16 
 
 
311 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  46.67 
 
 
311 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  46.67 
 
 
311 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  46.21 
 
 
313 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  46.92 
 
 
307 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  44.6 
 
 
313 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  46.9 
 
 
309 aa  228  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  49.13 
 
 
329 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  49.13 
 
 
329 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.66 
 
 
298 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  45.42 
 
 
313 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  43.36 
 
 
320 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.45 
 
 
314 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  43.97 
 
 
297 aa  223  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  44.41 
 
 
313 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.64 
 
 
310 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  41.84 
 
 
287 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  46.45 
 
 
312 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.2 
 
 
307 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  47.69 
 
 
312 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  43.11 
 
 
318 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.37 
 
 
313 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  42.61 
 
 
286 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  42.5 
 
 
294 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  44.41 
 
 
312 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  47.33 
 
 
312 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.55 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  47.75 
 
 
322 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.26 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  42.25 
 
 
286 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  43.1 
 
 
301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  46.21 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  47.24 
 
 
308 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.77 
 
 
308 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  43.11 
 
 
298 aa  210  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  48.1 
 
 
329 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 
300 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  46.88 
 
 
310 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  41.08 
 
 
294 aa  204  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  41.08 
 
 
294 aa  204  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  42.75 
 
 
298 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  41.33 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.43 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.43 
 
 
321 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  41.81 
 
 
317 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  42.12 
 
 
302 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  47.24 
 
 
338 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  38.52 
 
 
290 aa  200  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  38.57 
 
 
293 aa  200  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.2 
 
 
301 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  35.48 
 
 
293 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1415  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  49.75 
 
 
422 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  43.68 
 
 
302 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2947  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  48.47 
 
 
749 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  38.52 
 
 
292 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>