More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0863 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  80.7 
 
 
286 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  77.62 
 
 
290 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  72.03 
 
 
286 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  72.03 
 
 
286 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  61.27 
 
 
287 aa  357  9e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  59.09 
 
 
288 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  58.45 
 
 
288 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  51.58 
 
 
297 aa  278  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  49.83 
 
 
292 aa  277  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.91 
 
 
308 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  49.65 
 
 
296 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  49.12 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.62 
 
 
308 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  43.45 
 
 
319 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.62 
 
 
311 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  41.46 
 
 
301 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.26 
 
 
307 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  40.83 
 
 
312 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.66 
 
 
313 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.86 
 
 
298 aa  244  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  49.29 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.71 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  46.81 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.91 
 
 
311 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  43.01 
 
 
318 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  45.26 
 
 
295 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.11 
 
 
310 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.31 
 
 
311 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  43.9 
 
 
320 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.26 
 
 
319 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  46.37 
 
 
308 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  40.14 
 
 
321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.36 
 
 
314 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.79 
 
 
321 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  44.84 
 
 
289 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.86 
 
 
311 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.86 
 
 
311 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.61 
 
 
313 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  47.2 
 
 
290 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.16 
 
 
311 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.84 
 
 
311 aa  235  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  44.1 
 
 
314 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  45.67 
 
 
329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  45.67 
 
 
329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.86 
 
 
310 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  39.72 
 
 
286 aa  232  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  42.91 
 
 
745 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  42.96 
 
 
307 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  42.81 
 
 
293 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  42.81 
 
 
293 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  40.07 
 
 
313 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  42.71 
 
 
334 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  43.55 
 
 
313 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  41.61 
 
 
313 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  44.64 
 
 
322 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  44.88 
 
 
746 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  45.74 
 
 
735 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  44.56 
 
 
535 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  43.62 
 
 
286 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  45.36 
 
 
298 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  43.16 
 
 
534 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  45.04 
 
 
302 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  42.61 
 
 
309 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  44.29 
 
 
329 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  43.46 
 
 
746 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  44.91 
 
 
746 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  42.76 
 
 
746 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  42.76 
 
 
746 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  44.2 
 
 
292 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  43.31 
 
 
367 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  42.76 
 
 
746 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  41.75 
 
 
742 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  44.14 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  44.21 
 
 
746 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  44.44 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.95 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  42.96 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  44.64 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  42.61 
 
 
312 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  42.71 
 
 
298 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  42.61 
 
 
312 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  45.39 
 
 
288 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2884  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  45.86 
 
 
753 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2947  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  45.86 
 
 
749 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  40.56 
 
 
317 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  40.93 
 
 
748 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2574  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  45.49 
 
 
749 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0949  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  45.49 
 
 
749 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0199  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  45.49 
 
 
749 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  44.64 
 
 
338 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  41.79 
 
 
302 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.15 
 
 
770 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  40.64 
 
 
364 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  38.49 
 
 
293 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  41.7 
 
 
752 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1832  Prephenate dehydrogenase  39.76 
 
 
302 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  39.22 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0497  prephenate dehydrogenase  38.27 
 
 
293 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0756332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  37.37 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>