More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3644 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  87.1 
 
 
535 aa  898    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
534 aa  1048    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  78.27 
 
 
735 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  75.29 
 
 
746 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  74.13 
 
 
746 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  74.13 
 
 
746 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  73.84 
 
 
746 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  71.55 
 
 
746 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  78.18 
 
 
746 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  77.52 
 
 
746 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  70.03 
 
 
752 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  52.9 
 
 
742 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.6 
 
 
748 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  54.77 
 
 
750 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  50.71 
 
 
286 aa  294  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  54.77 
 
 
285 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  50.88 
 
 
290 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  50 
 
 
286 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  48.65 
 
 
770 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  49.83 
 
 
292 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  44.59 
 
 
780 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  51.89 
 
 
296 aa  264  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  44.95 
 
 
778 aa  263  8.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  49.48 
 
 
291 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  49.12 
 
 
293 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  46.6 
 
 
745 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  51.43 
 
 
288 aa  250  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  45.04 
 
 
293 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  45.04 
 
 
293 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  47 
 
 
289 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  48.79 
 
 
295 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  49.47 
 
 
313 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  42.52 
 
 
319 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  44.91 
 
 
286 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  47.52 
 
 
311 aa  236  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  43.9 
 
 
288 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  49.83 
 
 
308 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  45.04 
 
 
288 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  44.91 
 
 
310 aa  232  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  45.96 
 
 
290 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  44.69 
 
 
313 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.74 
 
 
311 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.49 
 
 
311 aa  229  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.1 
 
 
314 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  49.83 
 
 
329 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  49.83 
 
 
329 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  46.45 
 
 
311 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.09 
 
 
313 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  44.17 
 
 
297 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.96 
 
 
311 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  45.96 
 
 
311 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  45.24 
 
 
334 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  47 
 
 
307 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  47 
 
 
309 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  43.16 
 
 
286 aa  223  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  44.41 
 
 
313 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  44.56 
 
 
313 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  43.31 
 
 
286 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.3 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  43.82 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.41 
 
 
312 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  48.79 
 
 
322 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  42.09 
 
 
320 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  42.5 
 
 
294 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  46.45 
 
 
312 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.16 
 
 
298 aa  220  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  42.96 
 
 
286 aa  220  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.2 
 
 
307 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.94 
 
 
314 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.55 
 
 
308 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.04 
 
 
313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  46.98 
 
 
312 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  41.13 
 
 
287 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  49.13 
 
 
308 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  46.95 
 
 
312 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  49.13 
 
 
329 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  46.55 
 
 
313 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  39 
 
 
300 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  40.82 
 
 
294 aa  211  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.42 
 
 
308 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  40.82 
 
 
294 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.2 
 
 
311 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  42.76 
 
 
298 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  43.43 
 
 
298 aa  207  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  42.91 
 
 
301 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  38.52 
 
 
290 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  47.22 
 
 
310 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  40.89 
 
 
293 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  41.22 
 
 
301 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  35.84 
 
 
293 aa  203  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  49.13 
 
 
338 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.73 
 
 
321 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  38.79 
 
 
293 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.73 
 
 
321 aa  200  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  43.11 
 
 
302 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  41.79 
 
 
292 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  38.16 
 
 
292 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  40.97 
 
 
317 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0696  cyclohexadienyl dehydrogenase  46.1 
 
 
317 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  40.85 
 
 
319 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>