295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4079 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  56.95 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  55.93 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  54.21 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  38.8 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  35.25 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  35.79 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 		 293 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 		 293 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  38.14 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  37.06 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  39.39 
 
 		 370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  35.45 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  37 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  35.76 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 		 366 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  35.69 
 
 		 293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 		 288 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  34.45 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  34.78 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.74 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  34.45 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  37.15 
 
 		 292 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  39.2 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.04 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  35.05 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.24 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  28.96 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  37.79 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  36.81 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0497  prephenate dehydrogenase  36.04 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0756332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  35.17 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  38.1 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  37.37 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  38 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  33.1 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.55 
 
 		 748 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  35.64 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 287 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  38.62 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  35.09 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  36.59 
 
 		 286 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  37.29 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.66 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  32.04 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  39.11 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.32 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  35.79 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  36.46 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  36.46 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.27 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.44 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 		 280 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  35.79 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.84 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.01 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  34.6 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.45 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.22 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.15 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.27 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.63 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  33.79 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.15 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  35.76 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.56 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  30.65 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.01 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.01 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  35.44 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.67 
 
 		 742 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.67 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  34.88 
 
 		 360 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  37.15 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.22 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.15 
 
 		 750 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  32.77 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>